La Banque de données des mutations du gène DMD
UMD-DMD France
La banque de données UMD-DMD France est le résultat d'une étroite collaboration entre différents acteurs : des biologistes, des généticiens, des cliniciens et des bioinformaticiens. Cette banque de données est développée à partir de du logiciel ‘Universal Mutation Database’ (Béroud et al. 2005, Béroud et al. 2000). Ce logiciel, qui est aujourd'hui une référence mondiale pour créer des banques de données "knowlegebase", a été créé à l'aide du progiciel 4ème Dimension (4D).
La banque UMD-DMD France contient actuellement des données anonymes, permettant ainsi son accès via Internet. Les données sont saisies localement (Paris et Montpellier) et validées par des curateurs (experts). Si nécessaire (description incomplète de la mutation), les analyses moléculaires peuvent être complétées par le laboratoire de génétique de Montpellier. En effet, seules les informations moléculaires répondant aux critères exigés pour la curation peuvent être intégrées. Les données issues des 2 centres curateurs sont ensuite réunies dans la banque UMD-DMD France qui est hébergée à Montpellier. L'accès à ces données est possible à partir de n'importe quel navigateur web et ce quelque soit l'ordinateur utilisé. Aucune modification des données n'est possible directement via Internet, seul le curateur peut modifier ou intégrer de nouvelles données.
Architecture du système
Technologies utilisées
Navigateurs web
Internet Explorer 5.5 ou plus, Safari, Firefox...
Consultation des données
Accès aux fonctions d'analyse
Serveurs web
4ème Dimension et Apache
Apple MacOSX Server
Banque de données
4ème Dimension
Design et définition du contenu
Gestion dynamique des requêtes
Sécurité des données
Données anonymes
Transfert des données sécurisé (sftp)
Firewall
Accès physique aux serveurs réglementé
Onduleur, air conditionné, alarme anti-incendie, etc.
Archivage sur système RAID
etc.
Dernière mise à jour : 12/10/2009